Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms