Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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