Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATP1A4Q13733 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATP1A4Q13733 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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