Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CACNA1SQ13698 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CACNA1SQ13698 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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