Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CDH18Q13634 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CDH18Q13634 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms