Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TCOF1Q13428 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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