Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATMQ13315 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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