Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SKP2Q13309 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms