Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPA4Q13156 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPA4Q13156 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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