Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CALCOCO2Q13137 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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