Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CHAF1BQ13112 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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