Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CNTN1Q12860 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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