Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
E2F1Q01094 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms