Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
EPHB4P54760 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EPHB4P54760 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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