Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PGGT1BP53609 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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PGGT1BP53609 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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PGGT1BP53609 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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PGGT1BP53609 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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