Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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