Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ARHGEF4Q9NR80 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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