Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXQ1Q9C009 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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