Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RBM42Q9BTD8 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RBM42Q9BTD8 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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