Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ANKRD39Q53RE8 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ANKRD39Q53RE8 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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