Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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