Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC142Q17RM4 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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