Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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RTL8BQ17RB0 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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RTL8BQ17RB0 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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RTL8BQ17RB0 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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RTL8BQ17RB0 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
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RTL8BQ17RB0 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RTL8BQ17RB0 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
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