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| MAPKAPK3 | Q16644 | AL355497.1-201 | ENST00000406262 | 551 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-130P-201 | ENST00000411112 | 103 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL157709.1-201 | ENST00000412695 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MTND2P23-201 | ENST00000422990 | 651 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU1-131P-201 | ENST00000458943 | 161 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | APCS-201 | ENST00000255040 | 926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-1045P-201 | ENST00000516321 | 107 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-1046P-201 | ENST00000516538 | 107 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNA5SP402-201 | ENST00000517148 | 110 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AP002001.1-203 | ENST00000534002 | 267 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | U4.3-201 | ENST00000621047 | 82 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC091932.3-201 | ENST00000624223 | 323 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | STX7-202 | ENST00000367941 | 15791 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SAMD9L-201 | ENST00000318238 | 7134 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | NEDD4-205 | ENST00000506154 | 6751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SENP7-206 | ENST00000394094 | 4703 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU1-58P-201 | ENST00000362413 | 163 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.462-201 | ENST00000384268 | 102 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-937P-201 | ENST00000384325 | 106 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR518A2-201 | ENST00000384966 | 87 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU2-20P-201 | ENST00000410425 | 191 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | BX510359.4-201 | ENST00000423750 | 193 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR4435-2HG-213 | ENST00000451884 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC010210.1-203 | ENST00000513905 | 260 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNA5SP320-201 | ENST00000516263 | 124 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNY3P15-201 | ENST00000516297 | 97 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU7-193P-201 | ENST00000516723 | 65 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC025647.1-201 | ENST00000517879 | 253 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AP005660.1-201 | ENST00000522972 | 293 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC087463.2-201 | ENST00000565943 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC055872.1-201 | ENST00000570978 | 278 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL137847.3-201 | ENST00000611521 | 109 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CCPG1-203 | ENST00000442196 | 3453 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MUC15-202 | ENST00000436318 | 3118 nt | TSL 5 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
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| MAPKAPK3 | Q16644 | KPNA5-202 | ENST00000368564 | 11311 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC007336.1-201 | ENST00000576365 | 3828 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL596028.1-201 | ENST00000326971 | 197 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-1240P-201 | ENST00000365155 | 104 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU11-3P-201 | ENST00000391111 | 133 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AL390729.2-201 | ENST00000416137 | 156 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | IKZF2-209 | ENST00000442445 | 551 nt | TSL 5 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MTATP8P1-201 | ENST00000467115 | 207 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC010655.3-201 | ENST00000478818 | 450 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC006380.1-201 | ENST00000603598 | 186 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC136443.5-201 | ENST00000603741 | 370 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC011373.1-201 | ENST00000607270 | 237 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CTSLP2-204 | ENST00000629029 | 392 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RGPD1-204 | ENST00000559485 | 5247 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | ZMYM1-203 | ENST00000373330 | 4203 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | ARHGAP15-202 | ENST00000409869 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | TTC6-201 | ENST00000267368 | 1681 nt | TSL 5 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | CYSLTR1-201 | ENST00000373304 | 2576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | OGN-201 | ENST00000262551 | 2971 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR21-201 | ENST00000362134 | 72 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-770P-201 | ENST00000363929 | 105 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.214-201 | ENST00000364201 | 112 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORD114-30-201 | ENST00000364448 | 72 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | Y_RNA.276-201 | ENST00000364732 | 109 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | RNU6-1175P-201 | ENST00000365200 | 107 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | SNORD63-201 | ENST00000384262 | 68 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | MIR1253-201 | ENST00000408273 | 105 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | AC060773.1-201 | ENST00000421698 | 310 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | ELOCP20-201 | ENST00000422460 | 345 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| MAPKAPK3 | Q16644 | LINC02540-201 | ENST00000455554 | 570 nt | TSL 3 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |