Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKN1Q16512 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKN1Q16512 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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