Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ALX1Q15699 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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ALX1Q15699 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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ALX1Q15699 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ALX1Q15699 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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