Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SF1Q15637 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SF1Q15637 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SF1Q15637 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SF1Q15637 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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