Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SIX1Q15475 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SIX1Q15475 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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