Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEC23AQ15436 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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SEC23AQ15436 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SEC23AQ15436 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEC23AQ15436 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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