Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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PUM3Q15397 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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PUM3Q15397 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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PUM3Q15397 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PUM3Q15397 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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PUM3Q15397 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PUM3Q15397 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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