Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B3Q15393 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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