Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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PTPRKQ15262 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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PTPRKQ15262 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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PTPRKQ15262 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
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PTPRKQ15262 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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PTPRKQ15262 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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PTPRKQ15262 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PTPRKQ15262 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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