Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HERPUD1Q15011 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERPUD1Q15011 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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