Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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COL19A1Q14993 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
COL19A1Q14993 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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