Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD4Q14839 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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