Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RBM39Q14498 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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