Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
UBE4AQ14139 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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UBE4AQ14139 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE4AQ14139 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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