Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCARB2Q14108 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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