Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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CKAP5Q14008 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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CKAP5Q14008 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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CKAP5Q14008 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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CKAP5Q14008 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CKAP5Q14008 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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