Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GTF2H2Q13888 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms