Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKP1Q13835 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKP1Q13835 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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