Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PTCH1Q13635 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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PTCH1Q13635 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTCH1Q13635 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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