Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CUL3Q13618 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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