Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MTMR1Q13613 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MTMR1Q13613 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MTMR1Q13613 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MTMR1Q13613 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MTMR1Q13613 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
MTMR1Q13613 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MTMR1Q13613 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms