Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SKP2Q13309 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms