Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRIM28Q13263 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TRIM28Q13263 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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