Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTGDRQ13258 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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PTGDRQ13258 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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PTGDRQ13258 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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