Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PPFIA1Q13136 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PPFIA1Q13136 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PPFIA1Q13136 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PPFIA1Q13136 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PPFIA1Q13136 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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