Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms