Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL28Q13084 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL28Q13084 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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